Protein–RNA interactions for Protein: P07864

LDHC, L-lactate dehydrogenase C chain, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHCP07864 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LDHCP07864 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LDHCP07864 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LDHCP07864 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LDHCP07864 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LDHCP07864 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LDHCP07864 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LDHCP07864 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LDHCP07864 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LDHCP07864 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LDHCP07864 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LDHCP07864 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LDHCP07864 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LDHCP07864 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LDHCP07864 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LDHCP07864 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LDHCP07864 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LDHCP07864 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LDHCP07864 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LDHCP07864 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDHCP07864 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDHCP07864 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDHCP07864 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDHCP07864 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDHCP07864 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LDHCP07864 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LDHCP07864 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LDHCP07864 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LDHCP07864 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LDHCP07864 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LDHCP07864 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LDHCP07864 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LDHCP07864 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LDHCP07864 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LDHCP07864 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LDHCP07864 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LDHCP07864 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LDHCP07864 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LDHCP07864 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LDHCP07864 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LDHCP07864 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LDHCP07864 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LDHCP07864 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LDHCP07864 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LDHCP07864 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LDHCP07864 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LDHCP07864 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LDHCP07864 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LDHCP07864 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LDHCP07864 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LDHCP07864 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LDHCP07864 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDHCP07864 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LDHCP07864 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDHCP07864 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDHCP07864 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDHCP07864 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDHCP07864 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDHCP07864 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDHCP07864 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDHCP07864 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDHCP07864 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDHCP07864 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDHCP07864 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDHCP07864 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LDHCP07864 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDHCP07864 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDHCP07864 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDHCP07864 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LDHCP07864 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LDHCP07864 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LDHCP07864 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LDHCP07864 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LDHCP07864 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LDHCP07864 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LDHCP07864 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LDHCP07864 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDHCP07864 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDHCP07864 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDHCP07864 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDHCP07864 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDHCP07864 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LDHCP07864 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LDHCP07864 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LDHCP07864 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LDHCP07864 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LDHCP07864 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LDHCP07864 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LDHCP07864 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LDHCP07864 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LDHCP07864 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LDHCP07864 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LDHCP07864 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LDHCP07864 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LDHCP07864 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LDHCP07864 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LDHCP07864 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LDHCP07864 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LDHCP07864 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LDHCP07864 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms