Protein–RNA interactions for Protein: P07357

C8A, Complement component C8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8AP07357 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8AP07357 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8AP07357 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8AP07357 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8AP07357 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8AP07357 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8AP07357 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8AP07357 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8AP07357 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8AP07357 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8AP07357 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8AP07357 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8AP07357 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8AP07357 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8AP07357 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8AP07357 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8AP07357 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8AP07357 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8AP07357 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8AP07357 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8AP07357 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8AP07357 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8AP07357 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8AP07357 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8AP07357 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8AP07357 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8AP07357 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8AP07357 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8AP07357 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8AP07357 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8AP07357 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8AP07357 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8AP07357 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C8AP07357 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8AP07357 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8AP07357 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8AP07357 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8AP07357 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8AP07357 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8AP07357 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8AP07357 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8AP07357 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8AP07357 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8AP07357 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8AP07357 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8AP07357 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8AP07357 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8AP07357 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8AP07357 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
C8AP07357 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8AP07357 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C8AP07357 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8AP07357 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8AP07357 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8AP07357 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8AP07357 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8AP07357 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8AP07357 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
C8AP07357 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8AP07357 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8AP07357 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8AP07357 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C8AP07357 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C8AP07357 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C8AP07357 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
C8AP07357 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8AP07357 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8AP07357 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C8AP07357 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8AP07357 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8AP07357 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8AP07357 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8AP07357 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8AP07357 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8AP07357 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8AP07357 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8AP07357 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8AP07357 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
C8AP07357 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C8AP07357 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C8AP07357 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C8AP07357 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C8AP07357 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C8AP07357 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C8AP07357 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C8AP07357 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C8AP07357 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8AP07357 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8AP07357 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8AP07357 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8AP07357 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C8AP07357 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8AP07357 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8AP07357 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8AP07357 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8AP07357 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8AP07357 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8AP07357 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8AP07357 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8AP07357 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms