Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR3DP05423 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3DP05423 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms