Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYBBP04839 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYBBP04839 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYBBP04839 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYBBP04839 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYBBP04839 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYBBP04839 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYBBP04839 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYBBP04839 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYBBP04839 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYBBP04839 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYBBP04839 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYBBP04839 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYBBP04839 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYBBP04839 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYBBP04839 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYBBP04839 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYBBP04839 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYBBP04839 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYBBP04839 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYBBP04839 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYBBP04839 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CYBBP04839 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CYBBP04839 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CYBBP04839 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYBBP04839 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYBBP04839 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYBBP04839 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYBBP04839 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYBBP04839 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYBBP04839 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYBBP04839 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYBBP04839 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYBBP04839 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYBBP04839 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYBBP04839 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYBBP04839 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CYBBP04839 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYBBP04839 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYBBP04839 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYBBP04839 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYBBP04839 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYBBP04839 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYBBP04839 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYBBP04839 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYBBP04839 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYBBP04839 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYBBP04839 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYBBP04839 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYBBP04839 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYBBP04839 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYBBP04839 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYBBP04839 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYBBP04839 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYBBP04839 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYBBP04839 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYBBP04839 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYBBP04839 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYBBP04839 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYBBP04839 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYBBP04839 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYBBP04839 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYBBP04839 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYBBP04839 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYBBP04839 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYBBP04839 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYBBP04839 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYBBP04839 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYBBP04839 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYBBP04839 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYBBP04839 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYBBP04839 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYBBP04839 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CYBBP04839 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYBBP04839 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYBBP04839 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CYBBP04839 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYBBP04839 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYBBP04839 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYBBP04839 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYBBP04839 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYBBP04839 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYBBP04839 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYBBP04839 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CYBBP04839 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYBBP04839 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYBBP04839 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYBBP04839 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYBBP04839 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CYBBP04839 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYBBP04839 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYBBP04839 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYBBP04839 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYBBP04839 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYBBP04839 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CYBBP04839 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYBBP04839 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYBBP04839 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYBBP04839 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYBBP04839 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms