Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04436 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04436 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04436 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04436 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04436 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04436 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04436 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04436 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P04436 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P04436 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P04436 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04436 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04436 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04436 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04436 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04436 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04436 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04436 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P04436 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P04436 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P04436 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P04436 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P04436 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P04436 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P04436 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P04436 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P04436 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
P04436 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P04436 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P04436 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P04436 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04436 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04436 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04436 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04436 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04436 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04436 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04436 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04436 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P04436 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P04436 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P04436 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04436 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04436 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04436 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
P04436 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04436 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04436 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04436 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04436 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04436 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04436 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04436 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04436 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04436 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04436 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P04436 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P04436 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P04436 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P04436 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P04436 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P04436 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
P04436 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
P04436 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P04436 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P04436 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P04436 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
P04436 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P04436 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P04436 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04436 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04436 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04436 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04436 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04436 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04436 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P04436 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P04436 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P04436 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P04436 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04436 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04436 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04436 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04436 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04436 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04436 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04436 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
P04436 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04436 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04436 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04436 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04436 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04436 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P04436 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
P04436 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P04436 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
P04436 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P04436 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
P04436 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms