Protein–RNA interactions for Protein: P04435

TCRB, T-cell receptor beta chain V region CTL-L17, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBP04435 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCRBP04435 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCRBP04435 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCRBP04435 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCRBP04435 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCRBP04435 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCRBP04435 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCRBP04435 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCRBP04435 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCRBP04435 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCRBP04435 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCRBP04435 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCRBP04435 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCRBP04435 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCRBP04435 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCRBP04435 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCRBP04435 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCRBP04435 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCRBP04435 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCRBP04435 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCRBP04435 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCRBP04435 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCRBP04435 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCRBP04435 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCRBP04435 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCRBP04435 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCRBP04435 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCRBP04435 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCRBP04435 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCRBP04435 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCRBP04435 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCRBP04435 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCRBP04435 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCRBP04435 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCRBP04435 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCRBP04435 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCRBP04435 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TCRBP04435 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCRBP04435 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCRBP04435 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCRBP04435 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCRBP04435 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TCRBP04435 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCRBP04435 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCRBP04435 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCRBP04435 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCRBP04435 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCRBP04435 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCRBP04435 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCRBP04435 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCRBP04435 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCRBP04435 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCRBP04435 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCRBP04435 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCRBP04435 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCRBP04435 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCRBP04435 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCRBP04435 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCRBP04435 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCRBP04435 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCRBP04435 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCRBP04435 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCRBP04435 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCRBP04435 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCRBP04435 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCRBP04435 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCRBP04435 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCRBP04435 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCRBP04435 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCRBP04435 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCRBP04435 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TCRBP04435 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCRBP04435 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCRBP04435 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCRBP04435 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCRBP04435 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCRBP04435 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCRBP04435 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCRBP04435 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCRBP04435 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCRBP04435 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCRBP04435 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TCRBP04435 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCRBP04435 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCRBP04435 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCRBP04435 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCRBP04435 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCRBP04435 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCRBP04435 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCRBP04435 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCRBP04435 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCRBP04435 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCRBP04435 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCRBP04435 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCRBP04435 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCRBP04435 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCRBP04435 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCRBP04435 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCRBP04435 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCRBP04435 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms