Protein–RNA interactions for Protein: P04271

S100B, Protein S100-B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100BP04271 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
S100BP04271 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
S100BP04271 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
S100BP04271 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
S100BP04271 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S100BP04271 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S100BP04271 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S100BP04271 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S100BP04271 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S100BP04271 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S100BP04271 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S100BP04271 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S100BP04271 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S100BP04271 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
S100BP04271 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
S100BP04271 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
S100BP04271 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
S100BP04271 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
S100BP04271 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
S100BP04271 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
S100BP04271 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
S100BP04271 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
S100BP04271 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
S100BP04271 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
S100BP04271 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
S100BP04271 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
S100BP04271 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
S100BP04271 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
S100BP04271 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
S100BP04271 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
S100BP04271 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
S100BP04271 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
S100BP04271 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
S100BP04271 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
S100BP04271 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
S100BP04271 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
S100BP04271 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
S100BP04271 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
S100BP04271 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
S100BP04271 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
S100BP04271 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
S100BP04271 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
S100BP04271 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
S100BP04271 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
S100BP04271 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
S100BP04271 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
S100BP04271 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
S100BP04271 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
S100BP04271 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
S100BP04271 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
S100BP04271 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
S100BP04271 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
S100BP04271 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
S100BP04271 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
S100BP04271 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
S100BP04271 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
S100BP04271 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
S100BP04271 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
S100BP04271 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
S100BP04271 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
S100BP04271 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
S100BP04271 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
S100BP04271 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
S100BP04271 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
S100BP04271 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
S100BP04271 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
S100BP04271 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
S100BP04271 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
S100BP04271 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
S100BP04271 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
S100BP04271 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
S100BP04271 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
S100BP04271 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
S100BP04271 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
S100BP04271 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
S100BP04271 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
S100BP04271 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
S100BP04271 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
S100BP04271 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
S100BP04271 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
S100BP04271 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
S100BP04271 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
S100BP04271 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
S100BP04271 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
S100BP04271 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100BP04271 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100BP04271 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100BP04271 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100BP04271 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100BP04271 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100BP04271 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100BP04271 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100BP04271 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100BP04271 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100BP04271 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
S100BP04271 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
S100BP04271 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
S100BP04271 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
S100BP04271 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
S100BP04271 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms