Protein–RNA interactions for Protein: P02708

CHRNA1, Acetylcholine receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA1P02708 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA1P02708 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNA1P02708 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA1P02708 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.9 ms