Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1RP00736 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1RP00736 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1RP00736 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1RP00736 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1RP00736 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1RP00736 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1RP00736 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1RP00736 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1RP00736 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1RP00736 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1RP00736 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1RP00736 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1RP00736 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1RP00736 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1RP00736 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1RP00736 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1RP00736 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C1RP00736 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1RP00736 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1RP00736 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1RP00736 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1RP00736 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1RP00736 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1RP00736 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1RP00736 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1RP00736 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1RP00736 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1RP00736 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1RP00736 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1RP00736 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1RP00736 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1RP00736 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1RP00736 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1RP00736 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1RP00736 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1RP00736 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1RP00736 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C1RP00736 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C1RP00736 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C1RP00736 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1RP00736 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1RP00736 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1RP00736 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1RP00736 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1RP00736 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1RP00736 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1RP00736 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1RP00736 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1RP00736 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1RP00736 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1RP00736 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1RP00736 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1RP00736 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1RP00736 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1RP00736 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1RP00736 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1RP00736 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1RP00736 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1RP00736 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1RP00736 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1RP00736 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1RP00736 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
C1RP00736 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1RP00736 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1RP00736 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1RP00736 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1RP00736 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1RP00736 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1RP00736 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1RP00736 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1RP00736 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C1RP00736 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1RP00736 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1RP00736 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C1RP00736 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1RP00736 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C1RP00736 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1RP00736 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1RP00736 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1RP00736 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1RP00736 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1RP00736 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1RP00736 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1RP00736 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C1RP00736 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C1RP00736 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1RP00736 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1RP00736 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1RP00736 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1RP00736 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1RP00736 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1RP00736 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C1RP00736 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1RP00736 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1RP00736 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1RP00736 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1RP00736 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1RP00736 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1RP00736 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms