Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGPS1O95749 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GGPS1O95749 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms