Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBB3O95704 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBB3O95704 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBB3O95704 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBB3O95704 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBB3O95704 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBB3O95704 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBB3O95704 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBB3O95704 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBB3O95704 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBB3O95704 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBB3O95704 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBB3O95704 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBB3O95704 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBB3O95704 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBB3O95704 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBB3O95704 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBB3O95704 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBB3O95704 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBB3O95704 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBB3O95704 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBB3O95704 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBB3O95704 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBB3O95704 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APBB3O95704 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBB3O95704 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBB3O95704 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APBB3O95704 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBB3O95704 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBB3O95704 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBB3O95704 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBB3O95704 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBB3O95704 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APBB3O95704 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBB3O95704 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBB3O95704 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APBB3O95704 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBB3O95704 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBB3O95704 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBB3O95704 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBB3O95704 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBB3O95704 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBB3O95704 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBB3O95704 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBB3O95704 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APBB3O95704 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APBB3O95704 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBB3O95704 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBB3O95704 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBB3O95704 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBB3O95704 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBB3O95704 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBB3O95704 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
APBB3O95704 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBB3O95704 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBB3O95704 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
APBB3O95704 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBB3O95704 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBB3O95704 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBB3O95704 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBB3O95704 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBB3O95704 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBB3O95704 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBB3O95704 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBB3O95704 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBB3O95704 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBB3O95704 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBB3O95704 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBB3O95704 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBB3O95704 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APBB3O95704 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBB3O95704 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBB3O95704 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBB3O95704 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBB3O95704 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBB3O95704 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBB3O95704 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBB3O95704 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBB3O95704 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBB3O95704 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBB3O95704 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBB3O95704 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBB3O95704 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBB3O95704 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBB3O95704 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBB3O95704 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBB3O95704 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBB3O95704 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBB3O95704 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBB3O95704 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBB3O95704 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBB3O95704 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBB3O95704 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBB3O95704 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBB3O95704 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBB3O95704 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBB3O95704 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBB3O95704 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBB3O95704 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBB3O95704 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms