Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCELO95171 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCELO95171 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCELO95171 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCELO95171 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCELO95171 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCELO95171 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCELO95171 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCELO95171 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCELO95171 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCELO95171 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCELO95171 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCELO95171 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCELO95171 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCELO95171 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCELO95171 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCELO95171 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCELO95171 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCELO95171 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCELO95171 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCELO95171 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCELO95171 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCELO95171 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCELO95171 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCELO95171 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCELO95171 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCELO95171 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCELO95171 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCELO95171 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCELO95171 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCELO95171 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCELO95171 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCELO95171 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCELO95171 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCELO95171 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCELO95171 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCELO95171 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCELO95171 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCELO95171 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCELO95171 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCELO95171 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCELO95171 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCELO95171 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCELO95171 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCELO95171 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCELO95171 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCELO95171 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCELO95171 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCELO95171 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCELO95171 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCELO95171 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCELO95171 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCELO95171 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCELO95171 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCELO95171 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCELO95171 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCELO95171 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCELO95171 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCELO95171 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCELO95171 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCELO95171 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCELO95171 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCELO95171 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCELO95171 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCELO95171 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCELO95171 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCELO95171 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCELO95171 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCELO95171 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCELO95171 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCELO95171 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCELO95171 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCELO95171 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCELO95171 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCELO95171 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCELO95171 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCELO95171 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCELO95171 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCELO95171 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCELO95171 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCELO95171 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCELO95171 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCELO95171 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCELO95171 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCELO95171 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCELO95171 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCELO95171 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCELO95171 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCELO95171 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCELO95171 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCELO95171 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCELO95171 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCELO95171 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCELO95171 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCELO95171 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCELO95171 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCELO95171 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCELO95171 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCELO95171 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCELO95171 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms