Protein–RNA interactions for Protein: O75943

RAD17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD17O75943 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD17O75943 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD17O75943 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD17O75943 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD17O75943 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD17O75943 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD17O75943 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD17O75943 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD17O75943 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD17O75943 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD17O75943 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD17O75943 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD17O75943 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD17O75943 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD17O75943 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD17O75943 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD17O75943 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD17O75943 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD17O75943 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD17O75943 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD17O75943 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD17O75943 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD17O75943 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD17O75943 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD17O75943 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD17O75943 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD17O75943 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD17O75943 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD17O75943 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD17O75943 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD17O75943 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD17O75943 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD17O75943 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD17O75943 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD17O75943 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD17O75943 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD17O75943 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD17O75943 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD17O75943 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD17O75943 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD17O75943 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD17O75943 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD17O75943 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD17O75943 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD17O75943 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD17O75943 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD17O75943 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD17O75943 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD17O75943 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD17O75943 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD17O75943 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD17O75943 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD17O75943 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD17O75943 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD17O75943 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD17O75943 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD17O75943 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAD17O75943 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAD17O75943 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RAD17O75943 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RAD17O75943 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAD17O75943 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RAD17O75943 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD17O75943 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD17O75943 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD17O75943 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD17O75943 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD17O75943 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAD17O75943 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAD17O75943 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAD17O75943 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD17O75943 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD17O75943 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD17O75943 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD17O75943 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD17O75943 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD17O75943 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD17O75943 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD17O75943 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD17O75943 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD17O75943 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD17O75943 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD17O75943 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD17O75943 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD17O75943 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD17O75943 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD17O75943 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD17O75943 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD17O75943 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD17O75943 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD17O75943 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD17O75943 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD17O75943 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD17O75943 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD17O75943 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD17O75943 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD17O75943 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD17O75943 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD17O75943 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD17O75943 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms