Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP12O75317 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP12O75317 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP12O75317 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP12O75317 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP12O75317 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP12O75317 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP12O75317 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP12O75317 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP12O75317 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP12O75317 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP12O75317 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP12O75317 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP12O75317 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP12O75317 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP12O75317 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP12O75317 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP12O75317 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP12O75317 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP12O75317 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP12O75317 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP12O75317 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP12O75317 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP12O75317 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP12O75317 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP12O75317 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP12O75317 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP12O75317 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP12O75317 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP12O75317 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP12O75317 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP12O75317 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP12O75317 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP12O75317 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP12O75317 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP12O75317 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP12O75317 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP12O75317 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP12O75317 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP12O75317 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP12O75317 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP12O75317 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP12O75317 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP12O75317 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP12O75317 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP12O75317 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP12O75317 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP12O75317 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP12O75317 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP12O75317 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP12O75317 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP12O75317 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP12O75317 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP12O75317 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP12O75317 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP12O75317 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP12O75317 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP12O75317 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP12O75317 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP12O75317 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP12O75317 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP12O75317 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP12O75317 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP12O75317 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP12O75317 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP12O75317 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP12O75317 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP12O75317 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP12O75317 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP12O75317 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP12O75317 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP12O75317 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP12O75317 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP12O75317 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP12O75317 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP12O75317 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP12O75317 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP12O75317 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP12O75317 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP12O75317 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP12O75317 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP12O75317 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP12O75317 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP12O75317 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP12O75317 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP12O75317 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP12O75317 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP12O75317 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP12O75317 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP12O75317 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP12O75317 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP12O75317 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP12O75317 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP12O75317 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP12O75317 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP12O75317 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP12O75317 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP12O75317 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP12O75317 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP12O75317 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms