Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3BO75182 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3BO75182 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms