Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR5O60602 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR5O60602 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR5O60602 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR5O60602 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR5O60602 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR5O60602 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR5O60602 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR5O60602 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR5O60602 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR5O60602 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR5O60602 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR5O60602 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR5O60602 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR5O60602 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR5O60602 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR5O60602 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR5O60602 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR5O60602 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR5O60602 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR5O60602 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR5O60602 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR5O60602 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR5O60602 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR5O60602 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR5O60602 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR5O60602 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR5O60602 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR5O60602 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR5O60602 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR5O60602 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR5O60602 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR5O60602 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR5O60602 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR5O60602 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR5O60602 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR5O60602 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR5O60602 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR5O60602 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR5O60602 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR5O60602 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR5O60602 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR5O60602 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR5O60602 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR5O60602 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR5O60602 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR5O60602 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR5O60602 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR5O60602 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR5O60602 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR5O60602 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR5O60602 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR5O60602 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR5O60602 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR5O60602 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR5O60602 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR5O60602 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR5O60602 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR5O60602 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR5O60602 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR5O60602 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR5O60602 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR5O60602 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR5O60602 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR5O60602 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR5O60602 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR5O60602 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR5O60602 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR5O60602 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR5O60602 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR5O60602 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR5O60602 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR5O60602 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR5O60602 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR5O60602 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR5O60602 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR5O60602 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR5O60602 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR5O60602 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR5O60602 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR5O60602 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR5O60602 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR5O60602 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR5O60602 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR5O60602 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR5O60602 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR5O60602 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR5O60602 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR5O60602 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR5O60602 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLR5O60602 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLR5O60602 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLR5O60602 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLR5O60602 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR5O60602 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR5O60602 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR5O60602 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR5O60602 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR5O60602 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR5O60602 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms