Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SYNJ1O43426 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SYNJ1O43426 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.19
SYNJ1O43426 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
SYNJ1O43426 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
SYNJ1O43426 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms