Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TREHO43280 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREHO43280 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREHO43280 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TREHO43280 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TREHO43280 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TREHO43280 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TREHO43280 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TREHO43280 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TREHO43280 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TREHO43280 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TREHO43280 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TREHO43280 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TREHO43280 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TREHO43280 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TREHO43280 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TREHO43280 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TREHO43280 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TREHO43280 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TREHO43280 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TREHO43280 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TREHO43280 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TREHO43280 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TREHO43280 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TREHO43280 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TREHO43280 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TREHO43280 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TREHO43280 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TREHO43280 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TREHO43280 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TREHO43280 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TREHO43280 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TREHO43280 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TREHO43280 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TREHO43280 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TREHO43280 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TREHO43280 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TREHO43280 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TREHO43280 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TREHO43280 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TREHO43280 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TREHO43280 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TREHO43280 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TREHO43280 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TREHO43280 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TREHO43280 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TREHO43280 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TREHO43280 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TREHO43280 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TREHO43280 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TREHO43280 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TREHO43280 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TREHO43280 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TREHO43280 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TREHO43280 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TREHO43280 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TREHO43280 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TREHO43280 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TREHO43280 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
TREHO43280 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TREHO43280 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TREHO43280 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TREHO43280 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TREHO43280 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TREHO43280 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TREHO43280 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TREHO43280 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TREHO43280 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TREHO43280 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TREHO43280 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TREHO43280 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TREHO43280 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TREHO43280 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TREHO43280 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TREHO43280 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TREHO43280 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TREHO43280 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TREHO43280 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TREHO43280 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TREHO43280 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TREHO43280 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TREHO43280 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TREHO43280 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TREHO43280 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TREHO43280 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TREHO43280 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TREHO43280 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TREHO43280 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TREHO43280 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TREHO43280 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TREHO43280 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TREHO43280 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TREHO43280 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TREHO43280 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TREHO43280 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TREHO43280 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TREHO43280 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TREHO43280 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TREHO43280 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TREHO43280 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms