Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN3O15551 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLDN3O15551 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN3O15551 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms