Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMA3EO15041 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEMA3EO15041 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SEMA3EO15041 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA3EO15041 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA3EO15041 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA3EO15041 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA3EO15041 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA3EO15041 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA3EO15041 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA3EO15041 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms