Protein–RNA interactions for Protein: O14939

PLD2, Phospholipase D2, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD2O14939 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD2O14939 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD2O14939 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD2O14939 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD2O14939 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD2O14939 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD2O14939 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD2O14939 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD2O14939 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD2O14939 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD2O14939 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD2O14939 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD2O14939 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD2O14939 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD2O14939 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD2O14939 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD2O14939 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD2O14939 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD2O14939 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD2O14939 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD2O14939 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD2O14939 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD2O14939 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD2O14939 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD2O14939 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD2O14939 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD2O14939 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD2O14939 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLD2O14939 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLD2O14939 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLD2O14939 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLD2O14939 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLD2O14939 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLD2O14939 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLD2O14939 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLD2O14939 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLD2O14939 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLD2O14939 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PLD2O14939 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLD2O14939 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLD2O14939 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLD2O14939 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLD2O14939 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLD2O14939 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLD2O14939 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLD2O14939 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLD2O14939 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLD2O14939 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLD2O14939 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLD2O14939 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLD2O14939 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLD2O14939 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PLD2O14939 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PLD2O14939 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLD2O14939 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLD2O14939 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLD2O14939 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLD2O14939 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLD2O14939 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLD2O14939 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLD2O14939 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLD2O14939 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLD2O14939 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLD2O14939 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLD2O14939 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLD2O14939 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLD2O14939 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLD2O14939 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLD2O14939 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLD2O14939 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLD2O14939 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLD2O14939 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLD2O14939 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLD2O14939 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLD2O14939 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLD2O14939 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLD2O14939 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLD2O14939 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLD2O14939 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLD2O14939 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLD2O14939 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLD2O14939 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLD2O14939 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLD2O14939 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLD2O14939 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLD2O14939 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLD2O14939 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLD2O14939 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLD2O14939 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLD2O14939 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLD2O14939 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD2O14939 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD2O14939 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD2O14939 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD2O14939 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD2O14939 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD2O14939 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD2O14939 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD2O14939 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD2O14939 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms