Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKO14936 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKO14936 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKO14936 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKO14936 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKO14936 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKO14936 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKO14936 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKO14936 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKO14936 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKO14936 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKO14936 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKO14936 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKO14936 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKO14936 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKO14936 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKO14936 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKO14936 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKO14936 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKO14936 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKO14936 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKO14936 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKO14936 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKO14936 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKO14936 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKO14936 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASKO14936 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASKO14936 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASKO14936 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKO14936 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKO14936 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKO14936 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKO14936 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKO14936 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKO14936 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKO14936 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKO14936 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKO14936 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKO14936 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKO14936 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKO14936 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKO14936 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKO14936 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKO14936 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASKO14936 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASKO14936 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASKO14936 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASKO14936 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASKO14936 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASKO14936 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASKO14936 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASKO14936 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASKO14936 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASKO14936 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASKO14936 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASKO14936 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASKO14936 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASKO14936 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASKO14936 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASKO14936 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASKO14936 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASKO14936 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASKO14936 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASKO14936 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASKO14936 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASKO14936 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CASKO14936 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASKO14936 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASKO14936 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASKO14936 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASKO14936 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASKO14936 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CASKO14936 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASKO14936 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASKO14936 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASKO14936 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASKO14936 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASKO14936 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASKO14936 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASKO14936 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASKO14936 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASKO14936 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASKO14936 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASKO14936 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASKO14936 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASKO14936 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASKO14936 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASKO14936 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASKO14936 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASKO14936 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASKO14936 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASKO14936 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASKO14936 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASKO14936 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASKO14936 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASKO14936 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASKO14936 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASKO14936 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASKO14936 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASKO14936 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms