Protein–RNA interactions for Protein: O14525

ASTN1, Astrotactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASTN1O14525 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ASTN1O14525 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms