Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAF5O00463 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAF5O00463 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAF5O00463 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAF5O00463 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAF5O00463 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAF5O00463 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAF5O00463 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAF5O00463 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms