Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3CDO00329 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3CDO00329 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3CDO00329 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3CDO00329 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PIK3CDO00329 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3CDO00329 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3CDO00329 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3CDO00329 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3CDO00329 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3CDO00329 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3CDO00329 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3CDO00329 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3CDO00329 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3CDO00329 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3CDO00329 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3CDO00329 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3CDO00329 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PIK3CDO00329 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3CDO00329 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3CDO00329 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3CDO00329 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3CDO00329 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3CDO00329 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3CDO00329 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3CDO00329 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3CDO00329 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PIK3CDO00329 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3CDO00329 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3CDO00329 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3CDO00329 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3CDO00329 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PIK3CDO00329 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3CDO00329 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3CDO00329 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3CDO00329 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms