Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR4O00206 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR4O00206 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR4O00206 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR4O00206 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR4O00206 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR4O00206 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR4O00206 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR4O00206 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR4O00206 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR4O00206 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR4O00206 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR4O00206 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR4O00206 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR4O00206 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR4O00206 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR4O00206 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR4O00206 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR4O00206 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR4O00206 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR4O00206 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR4O00206 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR4O00206 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR4O00206 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR4O00206 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR4O00206 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR4O00206 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR4O00206 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR4O00206 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR4O00206 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR4O00206 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR4O00206 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR4O00206 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR4O00206 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR4O00206 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR4O00206 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR4O00206 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR4O00206 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR4O00206 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR4O00206 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR4O00206 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLR4O00206 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR4O00206 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR4O00206 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR4O00206 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR4O00206 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR4O00206 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR4O00206 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR4O00206 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR4O00206 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR4O00206 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR4O00206 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR4O00206 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR4O00206 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR4O00206 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR4O00206 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR4O00206 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR4O00206 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR4O00206 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR4O00206 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR4O00206 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR4O00206 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR4O00206 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR4O00206 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR4O00206 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR4O00206 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR4O00206 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR4O00206 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TLR4O00206 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR4O00206 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR4O00206 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR4O00206 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR4O00206 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR4O00206 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR4O00206 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR4O00206 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR4O00206 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR4O00206 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR4O00206 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR4O00206 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR4O00206 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR4O00206 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR4O00206 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR4O00206 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR4O00206 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR4O00206 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR4O00206 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR4O00206 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR4O00206 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR4O00206 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR4O00206 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR4O00206 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR4O00206 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR4O00206 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR4O00206 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR4O00206 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR4O00206 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR4O00206 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR4O00206 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR4O00206 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms