Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAP23O00161 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNAP23O00161 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNAP23O00161 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms