Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP17L12C9JPN9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP17L12C9JPN9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L12C9JPN9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms