Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PATL2C9JE40 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PATL2C9JE40 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms