Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4DXG7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4DXG7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
B4DXG7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
B4DXG7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DXG7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DXG7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DXG7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DXG7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DXG7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DXG7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DXG7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DXG7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4DXG7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4DXG7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4DXG7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4DXG7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4DXG7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4DXG7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DXG7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DXG7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DXG7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DXG7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DXG7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DXG7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DXG7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DXG7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DXG7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DXG7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DXG7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DXG7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DXG7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DXG7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DXG7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DXG7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DXG7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DXG7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DXG7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DXG7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DXG7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DXG7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DXG7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DXG7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DXG7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DXG7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DXG7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DXG7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DXG7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DXG7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DXG7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DXG7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DXG7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4DXG7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4DXG7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4DXG7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DXG7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DXG7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DXG7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DXG7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DXG7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DXG7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DXG7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DXG7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DXG7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DXG7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DXG7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DXG7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DXG7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DXG7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DXG7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DXG7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DXG7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DXG7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DXG7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DXG7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DXG7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DXG7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DXG7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DXG7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DXG7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DXG7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DXG7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DXG7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DXG7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DXG7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DXG7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DXG7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DXG7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DXG7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DXG7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DXG7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DXG7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DXG7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DXG7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DXG7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DXG7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DXG7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DXG7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DXG7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DXG7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms