Protein–RNA interactions for Protein: A8MV72

Putative UPF0607 protein ENSP00000382826, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MV72 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MV72 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MV72 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MV72 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MV72 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MV72 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MV72 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MV72 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MV72 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MV72 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MV72 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MV72 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MV72 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MV72 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MV72 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MV72 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MV72 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MV72 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
A8MV72 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A8MV72 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A8MV72 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MV72 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MV72 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MV72 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MV72 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MV72 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MV72 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MV72 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MV72 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MV72 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MV72 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MV72 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MV72 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MV72 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MV72 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MV72 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MV72 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MV72 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A8MV72 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A8MV72 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A8MV72 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A8MV72 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A8MV72 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A8MV72 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A8MV72 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A8MV72 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A8MV72 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A8MV72 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A8MV72 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A8MV72 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MV72 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MV72 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MV72 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MV72 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MV72 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MV72 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A8MV72 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A8MV72 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A8MV72 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A8MV72 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MV72 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MV72 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MV72 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MV72 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MV72 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MV72 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MV72 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MV72 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MV72 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MV72 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MV72 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MV72 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MV72 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MV72 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MV72 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MV72 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MV72 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MV72 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MV72 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MV72 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MV72 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MV72 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MV72 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MV72 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MV72 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MV72 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MV72 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MV72 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MV72 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MV72 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MV72 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MV72 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MV72 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MV72 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MV72 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MV72 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MV72 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MV72 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MV72 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MV72 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms