Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRN3P2A6NIE6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRN3P2A6NIE6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRN3P2A6NIE6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRN3P2A6NIE6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRN3P2A6NIE6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRN3P2A6NIE6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRN3P2A6NIE6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRN3P2A6NIE6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRN3P2A6NIE6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRN3P2A6NIE6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.1 ms