Protein–RNA interactions for Protein: A6NCS4

NKX2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-6A6NCS4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-6A6NCS4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-6A6NCS4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.5 ms