Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LCHNA4D1U4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LCHNA4D1U4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms