Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf170A2RU37 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms