Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC26A0AVF1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC26A0AVF1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC26A0AVF1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC26A0AVF1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC26A0AVF1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TTC26A0AVF1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC26A0AVF1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTC26A0AVF1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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