Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms