Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SLC39A9Q9NUM3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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