Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms