Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms