Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms