Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms