Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSCP56915 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSCP56915 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSCP56915 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSCP56915 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSCP56915 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSCP56915 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSCP56915 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSCP56915 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSCP56915 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSCP56915 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSCP56915 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSCP56915 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSCP56915 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms