Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms