Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms