Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms