Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XBP1P17861 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XBP1P17861 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms