Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMP1P11279 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms