Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HCG22E2RYF7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms