Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms